Wystartowała rekrutacja na kolejną edycję kursu „Omics Data Science – Bioinformatyka i Analiza Wielkoskalowych Danych Biomedycznych”. Organizatorem zajęć jest Interdyscyplinarne Centrum Modelowania Matematycznego i Komputerowego Uniwersytetu Warszawskiego.
Piąta edycja kursu odbędzie się w Warszawie, w terminie 17 lutego 2024 – 31 stycznia 2025 roku. Program kursu jest podzielony na dwa semestry i obejmuje ponad 200 godzin lekcyjnych wykładów i ćwiczeń, z naciskiem na zajęcia praktyczne. Omics Data Science w ICM UW łączy wykorzystanie narzędzi stosowanych w bioinformatyce
z wyzwaniami współczesnej genetyki. W pierwszym semestrze będą wykładane podstawy badań wysokoprzepustowych w medycynie i podstawy informatyki niezbędne do obliczeń wysokoprzepustowych. W drugim semestrze będą prowadzone wykłady i ćwiczenia z dziedzin omicznych. W ramach programu słuchacze są zobligowani do 30 godzin pracy własnej z określonych przedmiotów praktycznych, w grupach 4–5 osobowych pod nadzorem wykładowców.
W programie kursu Omics Data Science integrujemy wiedzę i umiejętności praktyczne z podstawowych języków programowania oraz nauk biologicznych, z zaawansowanymi badaniami multiomicznymi. Zajęcia z analizy danych wysokoprzepustowych w genomice, transkryptomice, epigenomice, metagenomice, proteomice oraz metabolomice, prowadzą badacze używający wspomnianych metod w codziennej pracy naukowej. Do piątej edycji kursu dołączyliśmy również techniki single-cell, coraz powszechniej używane w badaniach biomedycznych – informuje dr Katarzyna Suski-Grabowski, kierownik kursu Omics Data Science, adiunkt w ICM UW.
Pierwszym etapem rekrutacji jest rejestracja kandydatów poprzez stronę internetową. Zapisy trwają do wyczerpania limitu 24 miejsc. Zajęcia będą prowadzone w formie stacjonarnej.
Organizatorem kursu jest Interdyscyplinarne Centrum Modelowania Matematycznego i Komputerowego Uniwersytetu Warszawskiego. Jednostka prowadzi interdyscyplinarne badania naukowe w oparciu o modelowanie matematyczne, symulacje komputerowe oraz obliczenia wielo- i wielkoskalowe. W obszarze usług typu High Performance Computing (HPC) i usług chmurowych, ICM wspomaga użytkowników z całej Polski aktywnie korzystających z superkomputerów i infrastruktury obliczeniowej, sieciowej oraz przechowywania wielkich danych.
W naukach biologicznych i medycznych działalność ICM obejmuje m.in.: zastosowania sztucznej inteligencji, wizualizacji i analizy obrazowej w diagnostyce medycznej; epidemiologię i geografię zdrowia oraz modelowanie przebiegu epidemii (Model Epidemiologiczny ICM); identyfikację czynników genetycznych aktywacji syndromu PIMS (Paediatric multisystem inflammatory syndrome); metody informatyczne, aplikacje i API w bioinformatyce i genomice; systemy uczenia maszynowego i selekcji w biologii.
MK