Statut Towarzystwa Przyjació³ Nauk Poznañskiego zosta³ uchwalony przez 42 cz³onków−za³o¿ycieli na zebraniu konstytucyjnym 13 stycznia 1857 roku. Odwo³ano siê do tradycji i statutu Towarzystwa Warszawskiego Przyjació³ Nauk, rozwi±zanego po powstaniu listopadowym. W³adze pruskie blokowa³y mo¿liwo¶æ powo³ania w Poznaniu uniwersytetu, Towarzystwu uniemo¿liwi³y uzyskanie osobowo¶ci prawnej, zakaza³y urzêdnikom pañstwowym i nauczycielom akcesu, a poprzez niemieckich cz³onków kuratorium Biblioteki Raczyñskich wyrugowa³y Towarzystwo z lokalu w Bibliotece. Dzia³acze wielkopolscy nie ust±pili – prezes Towarzystwa, Karol Libelt, po³o¿y³ (6 maja 1874) kamieñ wêgielny pod pierwszy budynek. W Towarzystwie widziano ponadzaborow± reprezentacjê nauki polskiej – do czasu przekszta³cenia Towarzystwa Naukowego Krakowskiego w Akademiê Umiejêtno¶ci. TPN Poznañskie pertraktowa³o z W³adys³awem Platerem na temat ewentualnej opieki nad Muzeum Narodowym w Rapperswilu. Przeciwstawiaj±c siê roszczeniom nauki niemieckiej, Towarzystwo zorganizowa³o w Toruniu, 19 lutego 1873 roku, 400−lecie urodzin Miko³aja Kopernika.
Za cel statutowy przyjêto „pielêgnowanie nauk i umiejêtno¶ci w jêzyku polskim”. Zastrzegano: „Towarzystwo wy³±cza przedmioty dotycz±ce spraw publicznych i rz±dów obecnych krajowych”. Dzia³ano w wydzia³ach: Nauk Historycznych i Moralnych (nastêpnie by³ to Wydzia³ Historyczno−Literacki), Przyrodniczym (w latach 1896−1911 nazywany Wydzia³em Przyrodników i Techników), Lekarskim (od 1865), Nauk Ekonomicznych i Statystycznych (1871−78), Technicznym (1888−1916), Prawno−Ekonomicznym (1893−1921). W roku 1857 powsta³a Komisja Archeologiczna, przekszta³cona (1885) w sekcjê, a nastêpnie (1887) w Wydzia³ Archeologiczny. W roku 1916 powo³ano wydzia³y: Teologiczny oraz Sztuki. P³ynno¶æ struktury wydzia³owej wynika³a z charakteru Towarzystwa – grupowa³o mi³o¶ników nauki, ogarniêtych duchem pracy organizatorskiej. Biblioteka Towarzystwa powiêksza³a zasoby poprzez dary i wymianê – w roku 1880 liczy³a ponad 50 tys. tomów. Przy Towarzystwie funkcjonowa³y: Muzeum Staro¿ytno¶ci Polskich i S³owiañskich, gabinety: archeologiczny, pami±tek historycznych, numizmatyczny, historii naturalnej, a od roku 1870 – galeria obrazów i gabinet rycin. W roku 1895 wyodrêbniono dzia³ rêkopisów. Og³aszano otwarte konkursy na prace naukowe. Du¿± wagê przywi±zywano do stawiania pomników i wmurowywania tablic pami±tkowych po¶wiêconych zas³u¿onym Polakom. Znacz±ca dla przysz³o¶ci by³a te¿ akcja gromadzenia informacji o zabytkach. Maria Wojciechowska ocenia³a (1952), ¿e „w pierwszych dziesiêcioleciach istnienia Towarzystwa dominowa³y nauki humanistyczne, a w koñcu XIX stulecia i z pocz±tku XX nauki przyrodnicze, techniczne i lekarskie”.
Wielkim dzie³em Towarzystwa by³o powo³anie Uniwersytetu Poznañskiego – po latach zabiegów, dopiero po odzyskaniu niepodleg³o¶ci. Dokonano wtedy koniecznej reformy Towarzystwa, prowadz±cej w kierunku akademizacji. Towarzystwo przekaza³o czê¶æ agend instytucjom samorz±dowym i pañstwowym. Biblioteka Towarzystwa trafi³a pod zarz±d Biblioteki Uniwersyteckiej, a zbiory archeologiczne i przyrodnicze wesz³y jako depozyt do Muzeum Wielkopolskiego, podobnie gabinet pami±tek historycznych i czê¶æ galerii obrazów. W nowym statucie z 4 lipca 1921 wprowadzono nazwê Poznañskie Towarzystwo Przyjació³ Nauk. Zniesiono kategoriê „cz³onków dobrodziejów” oraz „cz³onków−korespondentów”. Odwo³uj±c siê do wzoru Komisji Ortograficznej Poznañskiej Towarzystwa, dzia³aj±cej w latach 1870−78, powo³ano na sta³e strukturê komisyjn±. Wchodzi³y do komisji tylko osoby „pracuj±ce naukowo”, tam te¿ ulokowano prace wydawnicze. Komisje delegowa³y swego reprezentanta do zarz±du PTPN, ich struktura powi±zana by³a z uk³adem fakultetów uniwersyteckich. W roku 1924 cz³onków zwyczajnych by³o 574, z tego 117 dzia³a³o w komisjach. Struktura wydzia³owa stopniowo wygasa³a – w latach 1927−39 funkcjonowa³y tylko do¶æ liczebne wydzia³y: Lekarski oraz Teologiczny. W efekcie tych zmian, jak wyja¶nia Wojciechowska: „Przetwarzaj±c siê w jakby przyboczn± instytucjê Uniwersytetu, zacie¶niaj±c dzia³alno¶æ prawie wy³±cznie do wspó³pracy z zak³adami uniwersyteckimi, a pozostawiaj±c cz³onków – (autochtonów) niezwi±zanych z Uniwersytetem na ¶lepym torze, Towarzystwo pracowa³o wprawdzie po¿ytecznie i wydajnie, ale straci³o kontakt z miejscowym spo³eczeñstwem”.
Trwale znacz±ca dla nauki dzia³alno¶æ badawcza ¶wiadczona by³a na forum Towarzystwa spo³ecznie. Koszty dzia³alno¶ci wydawniczej ros³y jednak na tyle, ¿e konieczne by³o wsparcie finansowe. PTPN korzysta³o z subwencji MWRiOP, a nastêpnie ze ¶rodków Funduszu Kultury Narodowej. Znacz±ce by³y te¿ dotacje samorz±dowe. Kwoty pozyskiwane ze sk³adek cz³onków (po 10 z³ od 1925) by³y niewielkie. Artyku³y prezentuj±ce wyniki badañ ukazywa³y siê w wydawanych przez komisje „Pracach”. Ostatni „Rocznik” (50) wydano w 1928 roku, prezentuj±c historiê Towarzystwa.
Powojenna odbudowa doprowadzi³a do akademizacji Towarzystwa, planowanej jeszcze przed wojn±. Przy okazji jubileuszowych obchodów (1947), w nowym statucie utrzymano nazwê PTPN, ale ca³kowicie odnowiono sk³ad i strukturê organizacyjn±. W nowych wydzia³ach: Filologiczno−Przyrodniczym oraz Lekarskim wprowadzono numerus clausus. Robocze zadania przypisano komisjom i komitetom, których sk³ad nie by³ limitowany. Gdy w³adze komunistyczne przyst±pi³y do „ofensywy ideologicznej”, warunki dzia³ania PTPN uleg³y znacz±cemu pogorszeniu, co Maria Wojciechowska nazwa³a „metod± powolnego wiêdniêcia”. Zablokowano prace badawcze i wydawnicze, kieruj±c wysi³ki Towarzystwa ku popularyzacji nauki. ¦rodkiem nacisku by³y finanse i cenzura. Tak± politykê wobec towarzystw naukowych realizowa³o Biuro Towarzystw Naukowych PAN.