ENGLISH BELOW | W dniach 7–9 kwietnia w Warszawie odbyło się pierwsze Międzynarodowe Sympozjum Przedkonferencyjne oraz Konferencja „Advancements of Microbiology 2025: The Role of Microbes in Tackling Threats to Health and the Environment”. Współorganizatorami były: Polskie Towarzystwo Mikrobiologów, Instytut Biochemii i Biofizyki PAN oraz Uniwersytet Warszawski.
Komitetowi organizacyjnemu przewodniczyły dr hab. Marta Zapotoczna (UW) oraz dr inż. Anna Detman-Ignatowska (IBB PAN). Sympozjum i konferencję współprowadzili dr Mary Turley (University of Birmingham) oraz dr Szymon Kubała (IBB PAN). Wydarzenie zgromadziło ponad 300 uczestników stacjonarnych oraz około 100 online.
Sympozjum Przedkonferencyjne zaprojektowane zostało z myślą o doktorantach oraz młodych naukowcach u progu kariery, było inspirowane formatem Gordon Research Seminars. Uczestnictwo ograniczono do młodych badaczy prezentujących oryginalne prace oraz zaproszonych doświadczonych naukowców, pełniących rolę prelegentów członków komitetu, a także mentorów młodego pokolenia. Takie podejście sprzyjało skoncentrowanej atmosferze wysokiego poziomu merytorycznego, inspirującym dyskusjom i stanowiło swoisty pomost międzypokoleniowej wymiany doświadczeń naukowych.
Sympozjum otworzył prof. Jan Potempa (University of Louisville/Uniwersytet Jagielloński) wykładem „Small is beautiful, but it could be dangerous”. Kolejne wykłady wygłosili: dr Gemma Murray (University College London), prof. Joan A. Geoghegan (University of Birmingham), prof. Piotr Garstecki (Scope Fluidics/IChF PAN), dr hab. Daniel Laubitz (University of Arizona) oraz dr hab. Anna Karnkowska (UW).
Sympozjum obejmowało sesje tematyczne: „AMR & Patogeneza”, „Innowacje i zastosowania mikroorganizmów” oraz „Flash Talk”. Nagrody za najlepsze wystąpienia otrzymali Rodolfo Brizola Toscan (UJ), Aleksander Gryciuk (PW) oraz Marta Sałek (UW).
Inaugurację konferencji poprowadziły dr hab. Marta Zapotoczna (UW) oraz dr inż. Anna Detman-Ignatowska (IBB PAN). Podczas inauguracji nagrody dla laureatów sympozjum wręczyli prof. Ewa Bulska (dyrektor Centrum Nauk Biologiczno-Chemicznych UW), prof. Róża Kucharczyk (zastępca dyrektora ds. infrastruktury badawczej i komercjalizacji IBB PAN) oraz prof. Stefan Tyski (prezes Polskiego Towarzystwa Mikrobiologów). Wykład inauguracyjny wygłosił prof. Jose Bengoechea (London School of Hygiene and Tropical Medicine) o interakcjach Klebsiella pneumoniae z makrofagami.
Program konferencji obejmował osiem sesji tematycznych: Sesję „Genomika patogenów” współmoderowali dr Marta Matuszewska (University of Cambridge), dr Gemma Murray (University College London) oraz dr hab. Rafał Mostowy (Małopolskie Centrum Biotechnologii UJ). Zaproszone wykłady wygłosili prof. Lucy A. Weinert oraz dr Chris Ruis (oboje z University of Cambridge). Omawiano zastosowanie genomiki w badaniu różnorodności bakterii, adaptacji do gospodarza i oporności na antybiotyki. Prelegenci analizowali ewolucję zoonoz, granice między komensalami a patogenami, monitoring Campylobacter, epidemiologię wirusów, genom Tannerella forsythia, chemogenomikę Vibrio cholerae oraz kompleks BAM u Escherichia coli.
Sesję „Terapie przeciwdrobnoustrojowe” moderowały dr Elżbieta Jagielska (IMDiK PAN) i dr Magdalena Płotka (Uniwersytet Gdański). Wykład plenarny wygłosił prof. Marcus Weingarth (Uniwersytet w Utrechcie). Podczas sesji przedstawiono nowe antybiotyki celujące w lipidy błonowe, enzymy selektywne wobec bakterii Staphylococcus, inhibitory enzymatyczne z nanonośnikami przeciw Candida albicans, endolizyny fagowe, terapię fotodynamiczną,
metabolity przeciwgrzybicze aktinobakterii, bakteryjne pęcherzyki jako nośniki substancji przeciwdrobnoustrojowych oraz wirusy onkolityczne w leczeniu nowotworów.
Sesję „Mikrobiologia środowiskowa” współmoderowali dr hab. Anna Karnkowska (UW), dr hab. Katarzyna Piwosz (Morski Instytut Rybacki – PIB) oraz prof. Zofia Piotrowska-Seget (Uniwersytet Śląski). Wykłady plenarne przedstawili prof. Rudolf Amann (Instytut Maxa Plancka Mikrobiologii Morskiej w Bremie) oraz prof. Ianina Altshuler (EPFL, Szwajcaria). Sesja obejmowała badania mikroorganizmów w ekosystemach lądowych, słodkowodnych i morskich. Omówiono obieg węgla przez bakterie heterotroficzne, fitoremediację z udziałem grzybów, wpływ amunicji chemicznej na mikrobiomy ryb, emisję gazów cieplarnianych z gleb zmarzlinowych oraz różnorodność planktonu.
Sesję „Interakcje gospodarz–patogen” prowadzili dr Jakub Kwieciński (Uniwersytet Jagielloński), prof. Joan Geoghegan (University of Birmingham) oraz dr hab. Agata Krawczyk-Balska (UW). Wykłady zaproszone wygłosili prof. Marc Lecuit (Instytut Pasteura) oraz prof. Andres Floto (University of Cambridge). Sesja obejmowała analizy zakażeń Listeria monocytogenes, zastosowanie larw danio pręgowanego w modelowaniu infekcji, ewolucję patogenności Pseudomonas aeruginosa oraz mechanizmy odporności w neutrofilach.
Sesję „Biotechnologia mikroorganizmów” moderowały prof. Jolanta Mierzejewska (Politechnika Warszawska), dr hab. Magdalena Kowalczyk (IBB PAN) i dr Małgorzata Kuś-Liśkiewicz (Uniwersytet Rzeszowski). Wykłady plenarne przedstawili prof. Illaria Maria Mannazzu (Uniwersytet w Sassari) oraz prof. Matthias Steiger (TU Wien). Wykłady
poświęcono procesom fermentacji, produkcji bio-wodoru, optymalizacji syntezy lipidów, biodegradowalnym opakowaniom oraz bioplastikom.
Sesję „Mikrobiomy w kontekście zdrowia i choroby” współprowadzili prof. Kinga Kowalska-Duplaga (Collegium Medicum UJ), prof. Tomasz Gosiewski (Collegium Medicum UJ) oraz dr Paweł Kiela (University of Arizona). Zaproszone wykłady wygłosili prof. Elin Org (University of Tartu) oraz prof. Kinga Kowalska-Duplaga (Collegium Medicum UJ). Prezentacje obejmowały wpływ mikrobiomu jelitowego na metabolizm leków, regulację lęku, wpływ diety na mikrobiom oraz rolę mikrobiomu w chorobach zapalnych jelit i przyzębia.
Sesję „Nowe techniki – nowe spojrzenie” prowadzili dr hab. Agata Starosta (IBB PAN), prof. Tim Foster (Trinity College Dublin) oraz dr Tomasz Kamiński (UW). Wykłady zaproszone przedstawili prof. Daniel Wilson (Uniwersytet w Hamburgu) oraz prof. Jörg Vogel (Helmholtz Institute for RNA-based Infection Research). Sesja prezentowała innowacje takie jak Cryo-EM w badaniach antybiotyków, programowalne antybiotyki RNA, metagenomiczne mapowanie optyczne oraz technologie kroplowe w analizie biofilmów.
Sesję „Mechanizmy oporności na środki przeciwdrobnoustrojowe i diagnostyka” współprowadzili prof. Jennifer Honda (University of Texas at Tyler), prof. Francesc Coll (Institute of Biomedicine of Valencia) oraz dr hab. Tomasz Jagielski (UW). Zaproszone wykłady wygłosili prof. Jennifer Honda i prof. Francesc Coll. Sesja dostarczyła wieloaspektowego spojrzenia na AMR jako zjawisko o złożonych uwarunkowaniach klinicznych, genetycznych i środowiskowych.
Poza sesjami tematycznymi, program konferencji obejmował również cykl wykładów specjalnych, poruszających szereg powiązanych zagadnień. Dr Piotr Tykarski (Uniwersytet Warszawski) omówił rolę platformy GBIF w monitoringu bioróżnorodności. Prof. Alessandra Scagliarini (Uniwersytet w Bolonii) przedstawiła praktyczne wdrażanie koncepcji One Health. Prof. Elżbieta Trafny (Wojskowy Instytut Medyczny) przybliżyła rolę czasopism PTM w publikowaniu badań mikrobiologicznych. Pomadto dr Gajane Żurawska (Bacteromic) zaprezentowała nowatorskie rozwiązania diagnostyczne w zakresie oporności na antybiotyki, podkreślając znaczenie szybkiej diagnostyki i personalizacji terapii.
Podczas sesji posterowych odbywających się każdego dnia konferencji zaprezentowano ponad 150 prac. Sukces wydarzenia był możliwy dzięki zaangażowaniu członków Komitetu Organizacyjnego i Naukowego oraz wsparciu Ministerstwa Nauki i Szkolnictwa Wyższego i innych instytucji, których pełna lista wraz z fotorelacja znajduje się na stronie internetowej www.advmicro2025.pl
Red.
_______________________________________________________________________________
From April 7 to 9, 2025, the First International Pre-Conference Symposium and Conference “Advancements of Microbiology 2025: The Role of Microbes in Tackling Threats to Health and the Environment” was held in Warsaw, Poland. The event was co-organised by the Polish Society of Microbiologists (PTM), the Institute of Biochemistry and Biophysics of the Polish Academy of Sciences (IBB PAS), and the University of Warsaw (UW).
The Organising Committee was co-chaired by Dr. hab. Marta Zapotoczna from the University of Warsaw and Dr. Eng. Anna Detman-Ignatowska from IBB PAS. The scientific proceedings were co-hosted by Dr. Mary Turley of the University of Birmingham and Dr. Szymon Kubała from IBB PAS, ensuring an engaging and well-coordinated experience for both in-person and virtual participants. The event gathered over 300 attendees onsite and approximately 100 online participants, creating a vibrant platform for scientific dialogue.
The Pre-Conference Symposium, held on April 7, was designed with early-career researchers and doctoral students in mind and was inspired by the format of Gordon Research Seminars. Participation was restricted to young scientists presenting original research and invited senior researchers who acted as speakers, committee members, and mentors to the next generation. This approach fostered a focused and intellectually stimulating environment that encouraged dynamic scientific discussion and intergenerational knowledge exchange. The symposium was opened by Prof. Jan Potempa (University of Louisville / Jagiellonian University), whose lecture titled “Small is beautiful, but it could be dangerous” reflected on his scientific journey and the molecular mechanisms of microbial pathogenicity. Subsequent lectures were delivered by Dr. Gemma Murray from University College London, Prof. Joan A. Geoghegan from the University of Birmingham, Prof. Piotr Garstecki representing Scope Fluidics and the Institute of Physical Chemistry PAS, Dr. hab. Daniel Laubitz from the University of Arizona, and Dr. hab. Anna Karnkowska from the University of Warsaw.
The symposium program included three thematic sessions: “AMR & Pathogenesis”, “Microbial Innovation & Applications” and “Flash Talk”. The high standard of presentations was reflected in the recognition of outstanding contributions. Awards were presented to Rodolfo Brizola Toscan from the Jagiellonian University, Aleksander Gryciuk from the Warsaw University of Technology, and Marta Sałek from the University of Warsaw.
The official inauguration of the main conference took place on April 8 and was led by Dr. hab. Marta Zapotoczna and Dr. Eng. Anna Detman-Ignatowska. During the opening ceremony, awards for the best symposium presentations were handed out by Prof. Ewa Bulska, Director of the Biological and Chemical Research Centre at UW, Prof. Róża Kucharczyk, Deputy Director for Research Infrastructure and Commercialization at IBB PAS, and Prof. Stefan Tyski, President of the Polish Society of Microbiologists. The conference began with an inaugural lecture by Prof. Jose Bengoechea from the London School of Hygiene and Tropical Medicine, who presented cutting-edge findings on interactions between Klebsiella pneumoniae and macrophages, shedding light on mechanisms of
immune evasion and pathogen persistence.
The scientific program of the conference consisted of eight thematic sessions. The “Pathogen Genomics” session, co-moderated by Dr. Marta Matuszewska (University of Cambridge), Dr. Gemma Murray (University College London), and Dr. hab. Rafał Mostowy (Małopolska Centre of Biotechnology, Jagiellonian University), addressed the use of
genomics to study bacterial diversity, host adaptation, and antimicrobial resistance. Keynote presentations were delivered by Prof. Lucy A. Weinert and Dr. Chris Ruis, both from the University of Cambridge. The session explored topics ranging from zoonotic evolution and genomic surveillance of Campylobacter to functional genomics of Tannerella forsythia, chemogenomics of Vibrio cholerae, and the BAM complex in Escherichia coli.
The session on “Antimicrobial Therapies”, chaired by Dr. Elżbieta Jagielska (IMDiK PAS) and Dr. Magdalena Płotka (University of Gdańsk), began with a plenary lecture by Prof. Marcus Weingarth (Utrecht University), who discussed the mechanisms of lipid-targeting antibiotics. The session featured research on lysostaphin-like enzymes, nanocarrier-based enzyme inhibitors targeting Candida albicans, phage endolysins, photodynamic therapy, actinobacterial antifungal metabolites, bacterial vesicles as antimicrobial carriers, and oncolytic viruses for cancer treatment.
The “Environmental Microbiology” session was co-moderated by Dr. hab. Anna Karnkowska (UW), Dr. hab. Katarzyna Piwosz (National Marine Fisheries Research Institute – PIB), and Prof. Zofia Piotrowska-Seget (University of Silesia). Prof. Rudolf Amann (Max Planck Institute for Marine Microbiology) and Prof. Ianina Altshuler (EPFL, Switzerland) gave keynote lectures. The session covered microbial processes in terrestrial, freshwater, and marine environments, focusing on carbon cycling by heterotrophic bacteria, phytoremediation with fungi, the impact of chemical munitions on fish microbiomes, greenhouse gas emissions from permafrost soils, and plankton diversity.
The “Host–Pathogen Interactions” session, led by Dr. Jakub Kwieciński (Jagiellonian University), Prof. Joan Geoghegan (University of Birmingham), and Dr. hab. Agata Krawczyk-Balska (University of Warsaw), included keynote lectures by Prof. Marc Lecuit (Pasteur Institute) and Prof. Andres Floto (University of Cambridge). The presentations explored Listeria monocytogenes infections, zebrafish larvae as infection models, Pseudomonas aeruginosa pathogenicity, and immune responses involving transcriptional memory in gingival fibroblasts and ROS production in neutrophils.
The “Microbial Biotechnology” session, chaired by Prof. Jolanta Mierzejewska (Warsaw University of Technology), Dr. hab. Magdalena Kowalczyk (IBB PAS), and Dr. Małgorzata Kuś-Liśkiewicz (University of Rzeszów), began with a keynote by Prof. Illaria Maria Mannazzu (University of Sassari) on using fermentation processes for producing functional food ingredients. Prof. Matthias Steiger (TU Wien) presented advances in metabolic engineering for CO₂ assimilation. The session addressed topics such as biohydrogen production, lipid synthesis in fungi, biodegradable food packaging, recombinant protein expression platforms, pyocyanin stimulation using carbon nanotubes, microbial bioplastics, and Arctic extremophiles.
The session “Microbiomes in the Context of Health and Disease”, co-chaired by Prof. Kinga Kowalska-Duplaga and Prof. Tomasz Gosiewski (both Collegium Medicum UJ), and Dr. Paweł Kiela (University of Arizona), featured lectures on how gut microbiomes influence drug metabolism, anxiety regulation, dietary effects on the microbiome, and their role in inflammatory bowel and periodontal diseases. Keynotes were given by Prof. Elin Org (University of Tartu) and Prof. Kinga Kowalska-Duplaga.
The “New Techniques – Novel Insights” session, chaired by Dr. hab. Agata Starosta (IBB PAS), Prof. Tim Foster (Trinity College Dublin), and Dr. Tomasz Kamiński (UW), introduced innovative technologies such as Cryo-EM, RNA-based antibiotics, metagenomic optical mapping, and droplet-based biofilm studies. Keynote lectures were presented by Prof. Daniel Wilson (University of Hamburg) and Prof. Jörg Vogel (Helmholtz Institute for RNA-based Infection Research).
The final session, “Mechanisms of Antimicrobial Resistance and Diagnostics”, was co-led by Prof. Jennifer Honda (University of Texas at Tyler), Prof. Francesc Coll (Institute of Biomedicine of Valencia), and Dr. hab. Tomasz Jagielski (UW). It provided a multifaceted view of antimicrobial resistance as a complex issue influenced by clinical, genetic, and environmental factors. The session included keynote presentations and research on diagnostic challenges, GWAS in AMR surveillance, fungal infections in immunocompromised patients, the roles of plasmids and phages, toxin-antitoxin systems, resistance in Arctic bacteria, and the impact of physical parameters on biofilm-related resistance.
Beyond the thematic sessions, the conference featured special lectures covering important interdisciplinary issues. Dr. Piotr Tykarski (University of Warsaw) discussed the role of the Global Biodiversity Information Facility (GBIF) in biodiversity monitoring. Prof. Alessandra Scagliarini (University of Bologna) presented practical applications of the One Health approach. Prof. Elżbieta Trafny (Military Medical Institute) highlighted the evolving role of PTM journals in microbiological publishing. Dr. Gajane Żurawska (Bacteromic) introduced new diagnostics for antimicrobial resistance, stressing the importance of rapid diagnostics and personalised therapy.
More than 150 posters were presented each day during the afternoon sessions. The success of this event was made possible thanks to the exceptional commitment of the Organising and Scientific Committees, Patrons and institutions. A complete list of committee members and participating institutions, as well as a photo gallery from the event, is available at www.advmicro2025.pl
